鹿茸的保存要特別小心，首要的是要注意空氣濕度問題，如果 空氣太潮濕，鹿茸就容易發霉，接著就會生蟲。所以首先要把鹿茸放在一個通風的地方，然后用布包一些花椒，放在鹿茸旁邊，這樣就不會招蟲了。如果保存得當，三五年內，鹿茸的藥效是不會發生變化的。鹿茸不宜長時間放在冰箱里,藥材放入冰箱內，和其他食物混放時間一長，不但各種細菌容易侵入藥材內，而且容易受潮，破壞了藥材的藥性若需長期保存，可放在一個干凈的玻璃瓶內，然后投入適量用文火炒至暗黃的糯米，待晾涼后放入，將瓶蓋封嚴，擱置在陰涼通風處。